出生在豬苗代小村莊的一個貧困農戶家庭。原名清作。明治時代日本農村艱苦的環境和貧困塑造了他堅毅的性格和終身克服困難的決心。

年僅一歲半時，在母親去田裡幹活期間不慎跌入家中的地爐。左手嚴重燒傷，手指粘連在一起。這一殘疾既成為他最大的挑戰，也成為他走上醫學道路的契機。

儘管家境貧寒且身有殘疾，仍開始在當地小學讀書。畸形的手使他成為欺凌的對象，但他學業出眾。一位名叫小林的老師發現了他的潛力，鼓勵他把教育作為前進的道路。

渡邊鼎醫生為他進行了左手修復手術，使其功能部分恢復。這次改變命運的經歷激勵年輕的清作立志學醫。同學和老師們為他籌集了手術費用，展示了社區支持的力量。

開始在為他治療手部的渡邊醫生門下當學徒。他一邊在診所幫忙，一邊刻苦學習醫學。此時，他將名字從清作改為英世，意為卓越的世界。

年僅20歲便通過了嚴格的醫師執照考試，是當時最年輕的合格者之一。這一來自農村、身有殘疾的青年的非凡成就，展示了他過人的智慧和決心。

開始在著名的傳染病研究所工作，師從發現鼠疫桿菌的北里柴三郎博士。這一職位使他接觸到前沿細菌學和國際科學網絡。

幾乎不懂英語、身無分文地離開日本，來到賓夕法尼亞大學。這一大膽的出國研究決定為他打開了世界一流設施的大門，最終成就了他最偉大的科學貢獻。

在新成立的洛克菲勒醫學研究所獲得職位，此後大部分職業生涯都在此度過。研究所為他提供了追求細菌學研究項目的資源和自由。

發表了關於蛇毒及其對人體影響的開創性研究。他研究毒素的系統方法為抗毒血清的開發做出了貢獻，確立了他作為嚴謹研究者的聲譽。

宣布成功培養引起梅毒的蒼白螺旋體，並證明其存在於麻痺性痴呆患者的腦中。這項研究將梅毒與神經疾病聯繫起來，為他贏得了國際聲譽。

因梅毒和其他傳染病研究首次獲得諾貝爾獎提名。雖未獲獎，但多次提名反映了國際科學界對他研究的高度認可。

前往南美研究奧羅亞熱和其他熱帶疾病。在艱苦條件下的實地考察表明他致力於在疾病自然發生地而非僅在實驗室了解疾病。

前往西非研究黃熱病，決心分離其病原體。儘管知道研究這種致命疾病的危險，他仍感到必須為找到能拯救無數生命的治療方法做出貢獻。

在研究過程中感染黃熱病去世。據說他最後的話是我不明白。他的死體現了對科學的最終犧牲，後來作為奉獻和堅韌的象徵被印在日本千元紙幣上。