Né fils de Hōjō Tokiyori et de son épouse principale. Le clan Hōjō gouvernait effectivement le Japon en tant que Shikken (régents) du shogunat de Kamakura, bien qu'ils ne fussent pas shoguns. Il naquit au cœur du gouvernement guerrier et porta dès son enfance la responsabilité de maintenir la stabilité du Japon.

Il commença son entraînement martial sous l'éducation stricte du Bushido. Il apprit le maniement du sabre, l'équitation, le tir à l'arc et les vertus de la voie du guerrier. Cette formation devait faire de lui un dirigeant résolu et inébranlable.

Il passa la cérémonie de Genpuku et reçut officiellement le nom de Tokimune. Cette cérémonie marqua son passage de l'adolescence à l'âge adulte et le début de ses devoirs en tant qu'héritier du clan Hōjō. Il fut ensuite intégré aux affaires gouvernementales du shogunat.

Il fut nommé Rensho (régent adjoint) et commença à participer aux affaires gouvernementales effectives. Malgré son jeune âge, il fit preuve d'une capacité de décision résolue et d'une compréhension profonde des affaires politiques.

Le Khan mongol Kubilaï envoya des émissaires portant une lettre exigeant la soumission du Japon et menaçant d'invasion militaire en cas de refus. C'était la plus grande menace extérieure de l'histoire du Japon, qui ébranla la cour et le gouvernement.

Il devint Shikken en pleine crise nationale. À seulement dix-sept ans, il dut mener le Japon face à la menace de l'Empire mongol. Il commença immédiatement à renforcer les défenses occidentales pour se préparer à une éventuelle invasion.

Face aux Mongols qui envoyèrent à nouveau des émissaires menaçants, il rejeta résolument la demande de soumission. Cette décision nécessitait un courage énorme, car l'Empire mongol avait déjà conquis de vastes territoires de la Chine à la Perse. Sa détermination engagea le Japon sur la voie de la résistance armée.

Il devint disciple du maître Zen Mugaku Sogen et s'adonna profondément à la pratique du Zen. Les exercices Zen l'aidèrent à maintenir la paix intérieure et la concentration au milieu de la crise nationale, devenant son pilier spirituel face à la menace mongole.

Une force mongole d'environ 30 000 hommes débarqua dans la baie de Hakata. Bien que les samouraïs japonais fussent en infériorité numérique, leur résistance acharnée empêcha l'ennemi d'avancer. Une tempête soudaine força la flotte mongole à se retirer, de nombreux navires coulant. Ce fut la première défense réussie contre une invasion étrangère dans l'histoire du Japon.

Lorsque les Mongols envoyèrent à nouveau des émissaires demandant la soumission, il ordonna l'exécution de tous les émissaires. Cet acte choqua beaucoup de monde, mais démontra aux Mongols la volonté inébranlable de résistance du Japon et unit la nation dans le combat.

Il ordonna la construction d'un mur de pierre de vingt kilomètres le long de la côte de la baie de Hakata – le plus grand ouvrage défensif de l'histoire du Japon. Des samouraïs de tout le pays furent mobilisés pour la construction. Cette fortification jouerait un rôle décisif lors de la seconde invasion mongole.

Kubilaï Khan envoya environ 140 000 soldats pour une nouvelle invasion. Le mur de pierre empêcha efficacement le débarquement ennemi, et les samouraïs japonais menèrent des raids nocturnes qui infligèrent de lourdes pertes à l'ennemi. Après deux mois, un typhon sans précédent détruisit la majeure partie de la flotte mongole, et des dizaines de milliers d'ennemis périrent noyés. Cette victoire mit fin pour toujours aux plans d'invasion mongole.

Il fonda le temple Engaku-ji pour honorer les morts des deux camps lors des deux invasions. Cela montrait son esprit bouddhiste de compassion – il honorait non seulement ses propres héros, mais priait aussi pour les âmes des ennemis tombés, révélant le caractère noble d'un guerrier.

La guerre contre les Mongols avait épuisé les finances du shogunat. Comme il s'agissait d'une guerre défensive, il n'y avait pas de butin pour récompenser, et de nombreux samouraïs qui avaient combattu ne purent être correctement rémunérés. Cette contradiction allait plus tard ébranler le règne du shogunat de Kamakura.

Il mourut de maladie à seulement trente-quatre ans. Il avait passé la plus grande partie de sa vie à repousser la menace mongole, et l'énorme pression avait probablement gravement endommagé sa santé. Il fut inhumé à l'Engaku-ji et est entré dans l'histoire comme le défenseur de l'indépendance du Japon.