Nasceu como filho de Matatias, ligado a uma linhagem sacerdotal de Jerusalém com conexões com os hasmoneus. Criado sob a política tensa da Judeia romana durante a dinastia herodiana, recebeu formação de elite em Escrituras, lei e línguas.

Na adolescência, estudou fariseus, saduceus e essênios, comparando suas interpretações da Torá e da autoridade. Também passou um período com o asceta do deserto Bannus, praticando austeridade e pureza ritual perto do ermo da Judeia.

Alinhou-se aos fariseus, movimento influente entre mestres e intérpretes da lei em Jerusalém. Essa escolha marcou seu estilo de escrita, enfatizando tradição, lei e causalidade moral diante da catástrofe nacional.

Foi enviado a Roma para pedir a libertação de sacerdotes judeus detidos pelo procurador Félix. Navegou redes imperiais e ganhou experiência direta do poder romano, das cortes e do patronato, o que depois influenciou suas histórias.

Em Roma, conseguiu o apoio de Popeia Sabina, esposa do imperador Nero, para que sua missão fosse bem-sucedida. Ao retornar com os sacerdotes libertos, aprendeu como influência pessoal e favor imperial podiam decidir destinos provinciais mais do que argumentos legais.

De volta à Judeia, viu a revolta explodir contra o domínio romano após anos de abusos fiscais e faccionalismo local. Com Jerusalém polarizada entre moderados e militantes, passou de observador a participante em uma guerra em rápida expansão.

As autoridades revolucionárias de Jerusalém o nomearam para organizar as defesas na Galileia, região crucial para controlar as rotas do norte. Fortificou cidades, negociou entre grupos rivais e lutou para impor disciplina em meio às divisões internas entre judeus.

Forças romanas sob Vespasiano e seu filho Tito sitiaram Jotapata após dura campanha pela Galileia. Josefo liderou a resistência durante o cerco e mais tarde apresentou a batalha como tragédia militar e ponto de inflexão moral para a Judeia.

Após a queda da cidade, foi capturado e levado diante de Vespasiano, escapando por pouco da execução. Alegou ter uma mensagem profética de que Vespasiano se tornaria imperador, previsão que depois o protegeu quando a política romana mudou.

No caótico "Ano dos Quatro Imperadores", Vespasiano tomou o poder e confirmou a previsão anterior de Josefo. Concederam-lhe liberdade e patronato, e ele adotou o nome da família Flávia, sinalizando uma nova identidade ligada à casa reinante.

Acompanhou Tito como intérprete, instando os defensores de Jerusalém a se renderem e pouparem a cidade. Seu relato posterior registra negociações, fome e violência faccional, enquadrando a destruição do Templo como calamidade nacional com causas internas na Judeia.

O Templo foi destruído durante a conquista de Tito, encerrando o culto central do Judaísmo do Segundo Templo. Josefo descreveu depois o evento com detalhes dramáticos, enfatizando fogo, saque e o colapso do centro religioso e cívico de Jerusalém.

Mudou-se para Roma, recebeu moradia e uma pensão, e trabalhou sob o patronato da corte flávia. Vivendo perto de círculos imperiais, começou a transformar suas experiências de guerra em histórias em língua grega para públicos romanos e da diáspora.

Concluiu "A Guerra Judaica", narrando a revolta de 66 a 73 com foco em líderes, batalhas e a queda de Jerusalém. Escrita para leitores educados do império, a obra combinou testemunho de quem viu os acontecimentos com uma defesa de suas escolhas e de sua comunidade.

Após a morte de Tito, Domiciano governou, e Josefo permaneceu em Roma, mantendo o trabalho literário e redes de patronato. Seus escritos passaram a corrigir estereótipos hostis e a apresentar a antiguidade judaica como respeitável no âmbito do saber greco-romano.

Finalizou "Antiguidades Judaicas", uma história ampla desde a criação até sua própria época, apoiando-se nas Escrituras e em registros anteriores. A obra buscou mostrar a lei e a tradição judaicas como antigas, racionais e compatíveis com a ordem civilizada.

Compôs "Vida" para responder a acusações, sobretudo as associadas a Justo de Tiberíades, sobre sua conduta na Galileia. O texto, em tom de memórias, esclarece cronologias, disputa a política local e o retrata como um comandante relutante preso a uma guerra civil.

Em "Contra Apião", rebateu polêmicas antijudaicas que circulavam em meios intelectuais greco-egípcios e romanos. Defendeu a antiguidade das Escrituras judaicas, a integridade de sua transmissão e a seriedade ética da lei judaica.

Morreu em Roma após décadas como o mais influente historiador judeu a escrever em grego sob o domínio imperial. Suas obras tornaram-se indispensáveis para compreender o Judaísmo do Segundo Templo, a Judeia romana e as consequências políticas da queda de Jerusalém.