몰도바 출신의 의무병 아버지와 러시아인 어머니 사이에서, 세미레치예 변방의 전초 도시 피시페크에서 태어났다. 여러 민족이 뒤섞인 초원 환경은 훗날 그가 제국과 혁명, 행정 문제를 실용적으로 바라보는 시각을 형성하는 데 영향을 주었다.

제국의 수도로 이동해 학생 불안이 커지던 시기 상트페테르부르크 공과대학에서 수학했다. 마르크스주의 서클과의 접촉은 그를 지하 정치 활동과 엄격한 조직 운영으로 이끌었다.

파업과 무장 충돌이 이어지는 가운데 러시아 사회민주노동당의 볼셰비키 파벌에 합류했다. 그는 선동 활동을 조직하는 데 관여했고, 제정 경찰의 압박 속에서 비밀 활동의 기술을 익혔다.

혁명 실패 이후 탄압이 강화되자 비밀경찰에 의해 체포되었다. 가혹한 형을 선고받아 수감과 유배의 세월이 시작되었고, 이는 당 내부에서 그의 강경한 평판을 굳히는 계기가 되었다.

급진적 정치 인물을 고립시키기 위한 제정의 국내 유배 제도에 따라 시베리아로 보내졌다. 그는 감시 속에서도 마르크스주의 문헌을 계속 읽고 볼셰비키 네트워크와의 연락을 유지했다.

전쟁이 시작되자 당국은 혁명 혐의자와 유배자에 대한 통제를 한층 강화했다. 프룬제는 전황을 면밀히 지켜보며 군사적 재난과 물자 부족이 군주정을 흔들 것이라 예상했다.

군주제가 무너진 뒤 유배에서 벗어나 지역 소비에트 정치에서 지도적 역할을 맡았다. 그는 노동자와 병사들 사이에서 볼셰비키의 영향력을 조직하며 이중 권력이 확산되는 흐름에 대응했다.

내전이 발발하자 그는 당 조직가에서 붉은 군대의 지휘관으로 전환했다. 팽창하는 군사 체계 속에서 엄격한 규율과 치밀한 계획으로 명성을 쌓았다.

시베리아에서 콜차크의 백군을 붕괴시키는 작전에서 고위 지휘를 맡았다. 여러 군과 철도 보급을 조율하며 우랄 지역에 대한 볼셰비키의 통제를 확보하는 데 기여했다.

투르케스탄 전선에 임명되어 히바 칸국과 부하라 토후국을 전복하는 원정을 지휘했다. 이 작전은 중앙아시아에서 소련 권력을 확대했지만, 지역 저항과 보급난에도 직면했다.

남부 전선의 지휘관으로서 크림에서 브랑겔 군에 대한 최종 공세를 조율했다. 돌파로 인해 세바스토폴에서 백군의 대규모 철수가 발생했고, 이는 내전의 주요 전투가 사실상 종결되는 계기가 되었다.

기근과 불안이 이어지던 전후 혼란 속에서 소련 통제의 안정화와 지휘 체계 재건에 관여했다. 그의 권위는 전장에서의 성과와 핵심 볼셰비키 지도자들과의 긴밀한 관계에 기반했다.

전략과 작전, 정치적 목표를 일치시키는 단일하고 일관된 군사 교리를 촉진했다. 그는 참모 교육과 현대적 계획 수립, 그리고 당의 감독 아래 구제정 전문가를 통합하는 방식을 강조했다.

레닌이 사망한 뒤 지도부 경쟁이 국가와 군의 최상층을 재편했다. 프룬제의 부상은 스탈린과 트로츠키 등 상층 볼셰비키들 사이의 긴장과 맞물려 전개되었다.

새 지도부의 일원으로 무장력 운영을 총괄하며 군사·해군 인민위원으로 취임했다. 그는 전후 회복이 취약한 상황에서 중앙집권화, 훈련 강화, 대비 태세를 목표로 한 개혁을 추진했다.

오랜 지병과 관련한 수술을 받은 뒤 얼마 지나지 않아 예상치 못하게 사망했다. 그의 죽음은 소련 지도부 내부의 강압과 음모에 대한 소문을 낳았고, 그 시대의 무자비한 파벌 투쟁을 반영했다.