Nació como hijo de Ōuchi Yoshioki, heredero de un poderoso clan del oeste de Honshu. Creció entre los gustos cortesanos del clan en Yamaguchi, donde la cultura al estilo de Kioto se mezclaba con la política guerrera.

De niño, vio a su padre Yoshioki retirarse de Kioto tras costosas intervenciones en los asuntos del shogunato. La experiencia mostró cómo la política lejana de la capital podía drenar recursos de Suo y Nagato.

Tras la muerte de Yoshioki, se convirtió en líder del clan Ōuchi y heredó extensas posesiones y redes comerciales. Se apoyó en vasallos veteranos, incluido Sue Harukata, para dirigir los ejércitos mientras él orientaba la política y la cultura.

Amplió Yamaguchi como una "Pequeña Kioto", invitando a poetas, pintores y nobles desplazados por la inestabilidad. La capital Ōuchi se hizo conocida por reuniones de poesía encadenada, ceremonias elegantes y una próspera cultura del libro.

Cultivó vínculos con instituciones zen que apoyaban la diplomacia y la alfabetización, recurriendo a monjes eruditos para el gobierno. Estas redes ayudaron al clan a comunicarse con socios de ultramar y a difundir nuevos textos.

El clan aprovechó puertos del Mar Interior y del norte de Kyushu para beneficiarse del transporte regional y del comercio exterior. Yoshitaka promovió canales regulados de intercambio que conectaban su dominio con bienes y conocimientos del continente.

A medida que Amago Haruhisa se expandía desde Izumo, Yoshitaka enfrentó presiones para luchar por la influencia en el oeste de Honshu. Las decisiones estratégicas dependieron cada vez más de generales como Sue Harukata y de otras ramas familiares militarizadas.

Con la misión de Francisco Javier entrando en Japón, Yoshitaka se convirtió en un daimio notable por su interés en visitantes y saberes extranjeros. Permitió que los jesuitas actuaran en su territorio, viendo posibles beneficios diplomáticos y comerciales.

Recibió a Francisco Javier y ofreció protecciones que permitieron a los misioneros predicar y viajar. El encuentro simbolizó la apertura de Yamaguchi a nuevas ideas, aunque muchos guerreros miraban la fe con recelo.

A medida que los arcabuces se difundían tras su introducción en Japón, las fuerzas de Yoshitaka afrontaron nuevas exigencias en el campo de batalla. Su administración intentó mantenerse al día mediante compras y comercio desde los puertos, aunque los rivales se adaptaron con rapidez.

Bajo presión para asegurar prestigio y territorio, autorizó operaciones ambiciosas contra bastiones del clan Amago. Las campañas tensaron las finanzas y la moral, agudizando las diferencias entre las prioridades cortesanas de Yoshitaka y las exigencias de sus generales.

Las repetidas cargas militares y el supuesto favoritismo hacia cortesanos cultivados alimentaron el resentimiento dentro del clan. Sue Harukata y otros líderes se presentaron cada vez más como defensores de un gobierno práctico y de la disciplina marcial.

A medida que el faccionalismo se profundizaba, Yoshitaka tuvo dificultades para equilibrar la legitimidad ritual con la realidad de la guerra. Cargos clave y mandos de castillos pasaron a la red de Sue Harukata, dejando al daimio aislado en su propia capital.

Sue Harukata actuó con decisión, tomó Yamaguchi y obligó a los leales a huir. El golpe, recordado como el incidente de Tainei-ji, destrozó el régimen Ōuchi que había dominado la política del oeste de Honshu.

Tras huir de la capital, buscó refugio, pero fue perseguido por las fuerzas de Sue y acorralado en Tainei-ji. Murió allí en 1551, marcando el fin efectivo del gobierno de Yoshitaka Ōuchi y de la edad dorada cultural del clan.