アフモーセはファラオ・セケンエンラー・タアと王妃アアホテプ1世の子としてテーベに生まれた。当時エジプトは第二中間期の分裂状態にあり、北部はヒクソス人がアヴァリスを拠点に支配していた。彼の誕生は後のエジプト統一への希望となった。

父セケンエンラー・タアがヒクソスとの戦いで命を落とした。ミイラに残された重傷の痕跡から激しい戦闘での死と推定されている。この悲劇的な出来事は幼いアフモーセの心に父の仇を討つという強い決意を植え付けることとなった。

兄カモセの死後、アフモーセは約10歳という幼さでファラオの座に就いた。母アアホテプ1世が摂政として国政を担い、息子を将来の偉大な統治者として育てながら王国を巧みに運営した。この時期に彼は軍事と政治の基礎を学んだ。

アフモーセはヒクソスの首都アヴァリスに対する最初の大規模な軍事遠征を開始した。これは外国支配者を徐々に弱体化させる一連の包囲戦の始まりであり、エジプト解放への長い道のりの第一歩となった。彼は新しい戦術と武器を導入して軍を強化した。

数年にわたる粘り強い包囲戦の末、アフモーセはついにヒクソスの首都アヴァリスを攻略した。この決定的な勝利はエジプトにおけるヒクソス支配の終焉を告げ、栄光ある新王国時代の幕開けとなった。彼はさらにカナンまで敵を追撃した。

アフモーセは南に転じ、ヒクソスと同盟を結んでいたヌビアの再征服に乗り出した。金や貴重な資源が豊富なこの地域へのエジプトの支配を回復し、国境を第二急流まで拡大することに成功した。これによりエジプトの富と権力は大いに増大した。

北と南の両方を確保したアフモーセは、ついにエジプトの完全な再統一を成し遂げた。彼は中央集権的な行政機構を確立し、ヒクソス時代に荒廃した神殿や記念碑の大規模な修復事業を開始した。これにより第18王朝の基盤が固められた。

アフモーセ1世は約25年の治世の後に死去し、再統一され強大となったエジプトを後世に残した。彼はドラ・アブ・エル・ナガ墓地に埋葬され、後世において第18王朝の神聖な創始者として崇拝されるようになった。彼の功績はエジプト史上最も重要なものの一つである。