スペイン植民地支配下の地方有力一族の家に、カルロス・アギナルドとトリニダード・ファミーの子として生まれた。カウィットでの成長は、地方行政や土地所有、そして高まりつつあった反植民地の緊張を幼い頃から身近に感じさせた。

カルロス・アギナルドの死後、正式な学業を離れてカビテで家業を助けた。この経験により地方の有力者層との結びつきが深まり、スペイン統治期の自治体権力の仕組みへの理解が鋭くなった。

カウィットの市長となり、カビテで行政権限と影響力を得た。この地位は、植民地の課税と治安維持、そして地下で広がる改革・革命ネットワークの交差点に彼を置いた。

秘密結社の蜂起後に革命が拡大すると、革命の大義に加わり、カビテで部隊を組織した。彼の地域指導力は、カビテをスペイン守備隊と聖職者に支えられた権威への重要な戦場へと押し上げた。

イムス周辺の戦闘を含むカビテでの目立った戦果を率い、革命派内部での評価を高めた。これらの作戦は戦術的な連携を示す一方で、指導権と戦略をめぐる内部論争も加速させた。

派閥対立のさなか、テヘロス会議で新たな革命政府の大統領に選ばれた。争いを呼ぶ手続きはアンドレス・ボニファシオとの緊張を強め、運動の指揮系統を作り替えた。

扇動の嫌疑を受け、アンドレス・ボニファシオは逮捕され、革命法廷で裁かれたのちマラゴンドンで処刑された。この出来事は革命の正義と権威、そして指導者としてのアギナルドの責任をめぐる長い論争を残した。

総督フェルナンド・プリモ・デ・リベラとビアクナバト協定を受け入れ、改革と補償金を条件に亡命へ同意した。戦闘はいったん沈静化したが、不信と不安はなお残り続けた。

亡命先で資金集めと武器調達のための革命委員会を組織した。委員会はマニラの情勢を注視し、米西戦争でスペインの立場が弱まる中、再開される衝突に備えた。

ジョージ・デューイ提督の指揮する米軍がフィリピンでスペインと交戦する中、香港から帰国した。軍を再建して革命の権威を回復し、スペインに勝てば独立が実現すると期待した。

六月十二日、自宅のあるカウィットで独立を宣言し、楽隊が国歌を奏でる中で国旗を掲げた。この宣言は新国家の主張を打ち出したが、外国の承認はなお不確かなままだった。

マロロス議会が憲法を制定したのち、フィリピン第一共和国の大統領として就任した。政府は制度整備、外交、正規軍の構築によって正統性を得ようとしたが、米国の圧力が強まっていった。

マニラ近郊の小競り合いをきっかけにフィリピン軍と米軍の武力衝突が拡大し、脆弱な交渉は終わった。新たな植民地勢力との戦争の中で、正面戦から機動的な抵抗へと戦い方を変えていった。

フレデリック・ファンストン将軍は偽装作戦とマカベベの偵察隊を用いてパラナンで彼を捕らえ、積極的な指揮は終わった。その後、米国への忠誠の宣誓を行い、平和と文民統治の受容を同胞に呼びかけた。

一九三五年のコモンウェルス選挙で大統領選に挑んだが、マヌエル・ケソンに敗れた。選挙戦は彼の知名度の持続を示す一方、制度化された政党政治への移行も浮き彫りにした。

日本による占領期に、協力を促す公的な呼びかけを行い、多くの人々から厳しく評価された。戦後、協力者として逮捕されたが、最終的には恩赦を受けた。

ディオスダド・マカパガル大統領は、公式の独立記念日を七月四日から六月十二日へと移し、一八九八年の独立宣言と一致させた。この変更は、彼の象徴的地位を高めた一方で、その選択をめぐる議論もなお続いた。

スペイン統治、米国の植民地化、日本占領、そして戦後共和国を見届けたのちに死去し、その人生は主要な時代をつなぐ橋となった。独立の象徴として称えられる一方、革命期の判断をめぐって評価が分かれる複雑な遺産を残した。