他出生於科拉萊霍的一個克里奧爾家庭，屬於新西班牙富庶的巴希奧地區。成長於莊園與原住民社群交織的環境，使他日後更關注不平等與地方怨情。

少年時期他遷往巴利亞多利德，進入宗教學院接受高等教育。該城是重要的教會中心，使他早早接觸教會政治、學術傳統與新西班牙的社會張力。

他深化神學與哲學訓練，並以敏銳才智建立名聲。他求學之際正逢波旁改革收緊西班牙控制並重塑殖民行政，對其思想產生影響。

他受祝聖後加入世俗聖職體系，這條道路在殖民社會中具有相當影響力。教區工作讓他日常接觸承受貢賦與困苦的原住民與混血家庭。

他與聖尼古拉斯學院建立關聯，該校是重要的聖職教育機構。他在此授課並辯論新的思想潮流，於學生與同儕神職人員間聲望日增。

他任校長期間提倡語言、哲學與實用知識，呼應西班牙世界流傳的啟蒙時代觀念。他的作風與獨立性有時與殖民教士的保守期待相衝突。

在與教會上級產生摩擦後，他被調離學術領導職位。此舉削弱他在巴利亞多利德的影響力，卻也使他更貼近教區生活與鄉村社群的經濟現實。

他接掌多洛雷斯教區，在這座小鎮上成為講壇之外的地方領袖。他扶持工坊與農業，試圖改善在殖民稅負與專賣壓力下受困的生計。

拿破崙入侵與斐迪南七世被囚動搖了西班牙帝國各地的正當性。在新西班牙，關於主權與治理的辯論愈發尖銳，伊達爾戈目睹克里奧爾人與城鎮居民間的不安擴散。

他參與討論擺脫半島派控制的網絡，將地方不滿與更宏觀的政治理念連結起來。聚會與通信使他與伊格納西奧·阿連德、胡安·阿爾達馬等未來盟友相互連繫。

在克雷塔羅，何塞法·奧爾蒂斯·德·多明格斯等人主持秘密集會，策劃起義。伊達爾戈成為關鍵人物，陰謀也從改革性的談論逐步轉向武裝反抗的準備。

他在清晨敲響教堂鐘聲，呼籲鎮民起身反抗殖民當局，從而揭開獨立運動序幕。他的號召迅速吸引原住民與混血支持者，使密謀轉化為群眾起義。

起義軍湧入瓜納華托並奪取糧倉堡壘，成為早期關鍵勝利。然而隨後的暴力事件驚動菁英，並促使保皇派更強硬抵抗，使他爭取廣泛正當性的努力更加艱難。

他率領的軍隊在十字山擊敗保皇派，打開通往首都的道路。逼近墨西哥城之際，軍紀、補給與政治抉擇左右了運動的氣勢與公眾觀感。

費利克斯·瑪麗亞·卡列哈率領的保皇派在卡爾德龍橋之戰擊潰起義軍，粉碎其主力。戰敗迫使領袖北撤，也暴露了叛軍內部深刻的戰略分歧。

在向美國邊境撤退途中，起義領導層遭背叛，於巴漢的阿卡蒂塔被逮捕。伊達爾戈、阿連德等人被拘押，結束了他對起義的直接指揮。

他接受教會與保皇派官員的訊問與審判，對方企圖以神父身分來否定其正當性。審理聚焦於叛亂與教義問題，而帝國則意圖以公開懲罰震懾後續的反抗。

他在奇瓦瓦遭行刑隊處決，結束了這位最著名早期領袖的生命。他的死使其成為獨立殉道者，激勵後來的領導者延續抗爭。